segunda-feira, 21 de setembro de 2020

Deoxyadenosina monohidratada

Existem oito nucleosídeos que constituem o DNA e o RNA, quais sejam, adenosina, guanosina, citidina, uridina, 2'-deoxiadenosina, 2'-deoxiguanosina, 2'-deoxicitidina e timidina (algumas vezes o símbolo 2' não é colocado explicitamente na nomenclatura das moléculas). Alguns deles já tiveram as suas propriedades vibracionais sob altas pressões investigadas por diversos laboratórios. Nesse trabalho o comportamento do cristal de deoxyadenosina monohidratado foi investigado sob condições de altas pressões de até 5,6 GPa. Uma possível transição de fase foi observada entre 0,6 e 0,8 GPa, como indicado por descontinuidades nos números de onda de alguns modos, incluindo de baixos números de onda. Adicionalmente, modos internos foram observados modificando-se durante a transição, incluindo a separação de um modo associado com uma deformação de um grupo HOC pertencente ao açúcar. É interessante que esse grupo de átomos participa de uma ligação de hidrogênio, indicando que a transição de fase envolve esse grupo particular. Note-se ainda que diferentemente do anel de 6 membros, o anel de 5 membros, como é o caso do açúcar nos nucleosídeos, são muito mais flexíveis. Assim, a transição pode ser interpretada como sendo parcialmente devida ao enrugamento do anel do açúcar, em particular, envolvendo o carbono C3'. Acima de 0,8 GPa os espectros variam continuamente, indicando que a célula unitária do cristal vai se adaptando continuamente na nova estrutura de alta pressão. [J.S.M. Quimbayo, R.A. Lima, D.L.M. Vasconcelos, P.T.C. Freire, Vibrational Spectroscopy 110, 103140 (2020)].




Tabela de Nucleosídeos (J.S.M. Quimbayo, Dissertação de Mestrado, UFC (2019)).



Calibração da pressão

A calibração da pressão no interior de uma célula a extremos de diamantes é uma importante etapa num experimento de altas pressões, seja ele...